Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Trim71Q1PSW8 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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