Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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