Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ttc39dQ0VF76 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms