Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Hoxd1Q01822 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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