Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pkp1P97350 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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