Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rpl28P41105 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms