Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtprmP28828 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PtprmP28828 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PtprmP28828 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PtprmP28828 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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