Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DffaO54786 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DffaO54786 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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