Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Eftud2O08810 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms