Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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H2-M1F7CXU4 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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H2-M1F7CXU4 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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H2-M1F7CXU4 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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H2-M1F7CXU4 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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