Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Col4a3Q9QZS0 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col4a3Q9QZS0 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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