Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Limd1Q9QXD8 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Limd1Q9QXD8 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Limd1Q9QXD8 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Limd1Q9QXD8 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Limd1Q9QXD8 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Limd1Q9QXD8 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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