Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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