Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RabggtaQ9JHK4 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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