Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccdc89Q9DA73 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc89Q9DA73 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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