Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 337.9 ms