Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Prdm5Q9CXE0 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm5Q9CXE0 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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