Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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