Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Nhlrc3Q8CCH2 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Nhlrc3Q8CCH2 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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