Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Atg4aQ8C9S8 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Atg4aQ8C9S8 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Atg4aQ8C9S8 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Atg4aQ8C9S8 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Atg4aQ8C9S8 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Atg4aQ8C9S8 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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