Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Usp38Q8BW70 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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