Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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