Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC0.96□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NipblQ6KCD5 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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