Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms