Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Rbbp4Q60972 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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Rbbp4Q60972 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms