Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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