Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms