Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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ptchd1Q14B62 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ptchd1Q14B62 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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