Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms