Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms