Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cd28P31041 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms