Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Eftud2O08810 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms