Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cln8Q9QUK3 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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