Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rabgef1Q9JM13 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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