Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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