Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc47Q9D024 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc47Q9D024 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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