Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rprd1bQ9CSU0 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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