Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ctu1Q99J10 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ctu1Q99J10 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ctu1Q99J10 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ctu1Q99J10 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ctu1Q99J10 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ctu1Q99J10 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ctu1Q99J10 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ctu1Q99J10 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
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Ctu1Q99J10 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ctu1Q99J10 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms