Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NischQ80TM9 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NischQ80TM9 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NischQ80TM9 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms