Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NipblQ6KCD5 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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