Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CltbQ6IRU5 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CltbQ6IRU5 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms