Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Pkp4Q68FH0 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Pkp4Q68FH0 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Pkp4Q68FH0 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Pkp4Q68FH0 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Pkp4Q68FH0 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Pkp4Q68FH0 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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Pkp4Q68FH0 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Pkp4Q68FH0 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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