Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Sft2d1Q5SSN7 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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