Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Trim71Q1PSW8 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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