Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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ptchd1Q14B62 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ptchd1Q14B62 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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