Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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Ttc39dQ0VF76 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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Ttc39dQ0VF76 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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Ttc39dQ0VF76 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Ttc39dQ0VF76 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Ttc39dQ0VF76 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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Ttc39dQ0VF76 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Ttc39dQ0VF76 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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