Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxd1Q01822 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Hoxd1Q01822 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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