Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpl28P41105 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpl28P41105 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms