Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PtprmP28828 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PtprmP28828 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PtprmP28828 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PtprmP28828 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PtprmP28828 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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