Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Prrt4B2RU40 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Prrt4B2RU40 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms